Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb3P09026 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb3P09026 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb3P09026 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb3P09026 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb3P09026 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb3P09026 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb3P09026 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb3P09026 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb3P09026 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb3P09026 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb3P09026 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb3P09026 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms