Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms