Protein–RNA interactions for Protein: B1AXP3

Saxo1, MCG1697, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saxo1B1AXP3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Saxo1B1AXP3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Saxo1B1AXP3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Saxo1B1AXP3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Saxo1B1AXP3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Saxo1B1AXP3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Saxo1B1AXP3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Saxo1B1AXP3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Saxo1B1AXP3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Saxo1B1AXP3 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Saxo1B1AXP3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Saxo1B1AXP3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Saxo1B1AXP3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Saxo1B1AXP3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Saxo1B1AXP3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Saxo1B1AXP3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Saxo1B1AXP3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Saxo1B1AXP3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Saxo1B1AXP3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Saxo1B1AXP3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Saxo1B1AXP3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Saxo1B1AXP3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Saxo1B1AXP3 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Saxo1B1AXP3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Saxo1B1AXP3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Saxo1B1AXP3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Saxo1B1AXP3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Saxo1B1AXP3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Saxo1B1AXP3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Saxo1B1AXP3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Saxo1B1AXP3 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Saxo1B1AXP3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Saxo1B1AXP3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Saxo1B1AXP3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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