Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhoP15409 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhoP15409 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhoP15409 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RhoP15409 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhoP15409 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhoP15409 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhoP15409 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhoP15409 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhoP15409 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhoP15409 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhoP15409 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhoP15409 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhoP15409 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhoP15409 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhoP15409 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhoP15409 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhoP15409 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RhoP15409 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhoP15409 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhoP15409 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhoP15409 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoP15409 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoP15409 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoP15409 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoP15409 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoP15409 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoP15409 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoP15409 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoP15409 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoP15409 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoP15409 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoP15409 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoP15409 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoP15409 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoP15409 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoP15409 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoP15409 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoP15409 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoP15409 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoP15409 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoP15409 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoP15409 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoP15409 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoP15409 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoP15409 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoP15409 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoP15409 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoP15409 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoP15409 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoP15409 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoP15409 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoP15409 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoP15409 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoP15409 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoP15409 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoP15409 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoP15409 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoP15409 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoP15409 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoP15409 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoP15409 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoP15409 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoP15409 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoP15409 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoP15409 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoP15409 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoP15409 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoP15409 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoP15409 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoP15409 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoP15409 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoP15409 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoP15409 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoP15409 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoP15409 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoP15409 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoP15409 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoP15409 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoP15409 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoP15409 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoP15409 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoP15409 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoP15409 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoP15409 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoP15409 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoP15409 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoP15409 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoP15409 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoP15409 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoP15409 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoP15409 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoP15409 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoP15409 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoP15409 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoP15409 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoP15409 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoP15409 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoP15409 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoP15409 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms