Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms