Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnga1P29974 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms