Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms