Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms