Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms