Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga1P29974 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms