Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms