Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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