Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms