Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms