Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5C7

Znf728, Zinc finger protein 728, mousemouse

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Length 752 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf728Q6P5C7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf728Q6P5C7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf728Q6P5C7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf728Q6P5C7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf728Q6P5C7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf728Q6P5C7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf728Q6P5C7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf728Q6P5C7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf728Q6P5C7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf728Q6P5C7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf728Q6P5C7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf728Q6P5C7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf728Q6P5C7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf728Q6P5C7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf728Q6P5C7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf728Q6P5C7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Znf728Q6P5C7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf728Q6P5C7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf728Q6P5C7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf728Q6P5C7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf728Q6P5C7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf728Q6P5C7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Znf728Q6P5C7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf728Q6P5C7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Znf728Q6P5C7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf728Q6P5C7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Znf728Q6P5C7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Znf728Q6P5C7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Znf728Q6P5C7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Znf728Q6P5C7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Znf728Q6P5C7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Znf728Q6P5C7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Znf728Q6P5C7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Znf728Q6P5C7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Znf728Q6P5C7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf728Q6P5C7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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