Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga1P29974 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms