Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms