Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdfS4R2K0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PdfS4R2K0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 294 ms