Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Top3bQ9Z321 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Top3bQ9Z321 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Top3bQ9Z321 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Top3bQ9Z321 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Top3bQ9Z321 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Top3bQ9Z321 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Top3bQ9Z321 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Top3bQ9Z321 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Top3bQ9Z321 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Top3bQ9Z321 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Top3bQ9Z321 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Top3bQ9Z321 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Top3bQ9Z321 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top3bQ9Z321 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top3bQ9Z321 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top3bQ9Z321 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top3bQ9Z321 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top3bQ9Z321 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top3bQ9Z321 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top3bQ9Z321 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top3bQ9Z321 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top3bQ9Z321 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top3bQ9Z321 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top3bQ9Z321 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top3bQ9Z321 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top3bQ9Z321 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top3bQ9Z321 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top3bQ9Z321 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top3bQ9Z321 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top3bQ9Z321 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top3bQ9Z321 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top3bQ9Z321 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top3bQ9Z321 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top3bQ9Z321 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top3bQ9Z321 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top3bQ9Z321 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top3bQ9Z321 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top3bQ9Z321 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top3bQ9Z321 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top3bQ9Z321 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top3bQ9Z321 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top3bQ9Z321 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Top3bQ9Z321 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top3bQ9Z321 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top3bQ9Z321 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Top3bQ9Z321 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Top3bQ9Z321 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Top3bQ9Z321 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Top3bQ9Z321 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Top3bQ9Z321 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top3bQ9Z321 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top3bQ9Z321 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top3bQ9Z321 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top3bQ9Z321 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top3bQ9Z321 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top3bQ9Z321 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Top3bQ9Z321 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top3bQ9Z321 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top3bQ9Z321 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top3bQ9Z321 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top3bQ9Z321 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top3bQ9Z321 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top3bQ9Z321 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top3bQ9Z321 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top3bQ9Z321 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top3bQ9Z321 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top3bQ9Z321 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top3bQ9Z321 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Top3bQ9Z321 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top3bQ9Z321 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Top3bQ9Z321 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Top3bQ9Z321 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top3bQ9Z321 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top3bQ9Z321 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top3bQ9Z321 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top3bQ9Z321 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top3bQ9Z321 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top3bQ9Z321 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top3bQ9Z321 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top3bQ9Z321 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top3bQ9Z321 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top3bQ9Z321 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Top3bQ9Z321 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top3bQ9Z321 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top3bQ9Z321 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top3bQ9Z321 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Top3bQ9Z321 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Top3bQ9Z321 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Top3bQ9Z321 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top3bQ9Z321 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top3bQ9Z321 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Top3bQ9Z321 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Top3bQ9Z321 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Top3bQ9Z321 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Top3bQ9Z321 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Top3bQ9Z321 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Top3bQ9Z321 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Top3bQ9Z321 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top3bQ9Z321 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms