Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Knop1Q9Z2Q2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Knop1Q9Z2Q2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Knop1Q9Z2Q2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Knop1Q9Z2Q2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Knop1Q9Z2Q2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Knop1Q9Z2Q2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Knop1Q9Z2Q2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Knop1Q9Z2Q2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Knop1Q9Z2Q2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Knop1Q9Z2Q2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Knop1Q9Z2Q2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Knop1Q9Z2Q2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Knop1Q9Z2Q2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Knop1Q9Z2Q2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Knop1Q9Z2Q2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Knop1Q9Z2Q2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Knop1Q9Z2Q2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Knop1Q9Z2Q2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Knop1Q9Z2Q2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Knop1Q9Z2Q2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Knop1Q9Z2Q2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Knop1Q9Z2Q2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Knop1Q9Z2Q2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Knop1Q9Z2Q2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Knop1Q9Z2Q2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Knop1Q9Z2Q2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Knop1Q9Z2Q2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Knop1Q9Z2Q2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Knop1Q9Z2Q2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Knop1Q9Z2Q2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Knop1Q9Z2Q2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Knop1Q9Z2Q2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Knop1Q9Z2Q2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Knop1Q9Z2Q2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Knop1Q9Z2Q2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Knop1Q9Z2Q2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Knop1Q9Z2Q2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Knop1Q9Z2Q2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Knop1Q9Z2Q2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Knop1Q9Z2Q2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Knop1Q9Z2Q2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Knop1Q9Z2Q2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Knop1Q9Z2Q2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Knop1Q9Z2Q2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Knop1Q9Z2Q2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Knop1Q9Z2Q2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Knop1Q9Z2Q2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Knop1Q9Z2Q2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Knop1Q9Z2Q2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Knop1Q9Z2Q2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Knop1Q9Z2Q2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Knop1Q9Z2Q2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Knop1Q9Z2Q2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Knop1Q9Z2Q2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Knop1Q9Z2Q2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Knop1Q9Z2Q2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Knop1Q9Z2Q2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Knop1Q9Z2Q2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Knop1Q9Z2Q2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Knop1Q9Z2Q2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Knop1Q9Z2Q2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Knop1Q9Z2Q2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Knop1Q9Z2Q2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Knop1Q9Z2Q2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Knop1Q9Z2Q2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Knop1Q9Z2Q2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Knop1Q9Z2Q2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Knop1Q9Z2Q2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Knop1Q9Z2Q2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Knop1Q9Z2Q2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Knop1Q9Z2Q2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Knop1Q9Z2Q2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Knop1Q9Z2Q2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Knop1Q9Z2Q2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Knop1Q9Z2Q2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Knop1Q9Z2Q2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Knop1Q9Z2Q2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Knop1Q9Z2Q2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Knop1Q9Z2Q2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Knop1Q9Z2Q2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Knop1Q9Z2Q2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Knop1Q9Z2Q2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Knop1Q9Z2Q2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Knop1Q9Z2Q2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Knop1Q9Z2Q2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Knop1Q9Z2Q2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Knop1Q9Z2Q2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Knop1Q9Z2Q2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms