Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trip6Q9Z1Y4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trip6Q9Z1Y4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trip6Q9Z1Y4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trip6Q9Z1Y4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trip6Q9Z1Y4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Trip6Q9Z1Y4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trip6Q9Z1Y4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trip6Q9Z1Y4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trip6Q9Z1Y4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trip6Q9Z1Y4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trip6Q9Z1Y4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Trip6Q9Z1Y4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Trip6Q9Z1Y4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trip6Q9Z1Y4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Trip6Q9Z1Y4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trip6Q9Z1Y4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trip6Q9Z1Y4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trip6Q9Z1Y4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trip6Q9Z1Y4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trip6Q9Z1Y4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trip6Q9Z1Y4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trip6Q9Z1Y4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trip6Q9Z1Y4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Trip6Q9Z1Y4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trip6Q9Z1Y4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trip6Q9Z1Y4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trip6Q9Z1Y4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trip6Q9Z1Y4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Trip6Q9Z1Y4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trip6Q9Z1Y4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trip6Q9Z1Y4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Trip6Q9Z1Y4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Trip6Q9Z1Y4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Trip6Q9Z1Y4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trip6Q9Z1Y4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trip6Q9Z1Y4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trip6Q9Z1Y4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trip6Q9Z1Y4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trip6Q9Z1Y4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trip6Q9Z1Y4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trip6Q9Z1Y4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trip6Q9Z1Y4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trip6Q9Z1Y4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trip6Q9Z1Y4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trip6Q9Z1Y4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trip6Q9Z1Y4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trip6Q9Z1Y4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Trip6Q9Z1Y4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trip6Q9Z1Y4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trip6Q9Z1Y4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trip6Q9Z1Y4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trip6Q9Z1Y4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trip6Q9Z1Y4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trip6Q9Z1Y4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trip6Q9Z1Y4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trip6Q9Z1Y4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trip6Q9Z1Y4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trip6Q9Z1Y4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trip6Q9Z1Y4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Trip6Q9Z1Y4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trip6Q9Z1Y4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trip6Q9Z1Y4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trip6Q9Z1Y4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trip6Q9Z1Y4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trip6Q9Z1Y4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Trip6Q9Z1Y4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trip6Q9Z1Y4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trip6Q9Z1Y4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trip6Q9Z1Y4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trip6Q9Z1Y4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trip6Q9Z1Y4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trip6Q9Z1Y4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trip6Q9Z1Y4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trip6Q9Z1Y4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trip6Q9Z1Y4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trip6Q9Z1Y4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Trip6Q9Z1Y4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trip6Q9Z1Y4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trip6Q9Z1Y4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trip6Q9Z1Y4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Trip6Q9Z1Y4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trip6Q9Z1Y4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trip6Q9Z1Y4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trip6Q9Z1Y4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trip6Q9Z1Y4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trip6Q9Z1Y4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trip6Q9Z1Y4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trip6Q9Z1Y4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.1 ms