Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gabbr1Q9WV18 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gabbr1Q9WV18 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gabbr1Q9WV18 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gabbr1Q9WV18 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gabbr1Q9WV18 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gabbr1Q9WV18 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gabbr1Q9WV18 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gabbr1Q9WV18 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gabbr1Q9WV18 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gabbr1Q9WV18 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gabbr1Q9WV18 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gabbr1Q9WV18 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gabbr1Q9WV18 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gabbr1Q9WV18 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gabbr1Q9WV18 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gabbr1Q9WV18 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gabbr1Q9WV18 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gabbr1Q9WV18 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gabbr1Q9WV18 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gabbr1Q9WV18 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gabbr1Q9WV18 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gabbr1Q9WV18 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gabbr1Q9WV18 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gabbr1Q9WV18 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gabbr1Q9WV18 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gabbr1Q9WV18 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gabbr1Q9WV18 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gabbr1Q9WV18 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gabbr1Q9WV18 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gabbr1Q9WV18 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gabbr1Q9WV18 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gabbr1Q9WV18 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gabbr1Q9WV18 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gabbr1Q9WV18 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gabbr1Q9WV18 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gabbr1Q9WV18 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gabbr1Q9WV18 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabbr1Q9WV18 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabbr1Q9WV18 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabbr1Q9WV18 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabbr1Q9WV18 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabbr1Q9WV18 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabbr1Q9WV18 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabbr1Q9WV18 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gabbr1Q9WV18 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gabbr1Q9WV18 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gabbr1Q9WV18 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gabbr1Q9WV18 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gabbr1Q9WV18 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gabbr1Q9WV18 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gabbr1Q9WV18 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gabbr1Q9WV18 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gabbr1Q9WV18 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gabbr1Q9WV18 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gabbr1Q9WV18 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gabbr1Q9WV18 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gabbr1Q9WV18 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gabbr1Q9WV18 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabbr1Q9WV18 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabbr1Q9WV18 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabbr1Q9WV18 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabbr1Q9WV18 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabbr1Q9WV18 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabbr1Q9WV18 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gabbr1Q9WV18 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gabbr1Q9WV18 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms