Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUN8

Lbx2, Transcription factor LBX2, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx2Q9WUN8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lbx2Q9WUN8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lbx2Q9WUN8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lbx2Q9WUN8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lbx2Q9WUN8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lbx2Q9WUN8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lbx2Q9WUN8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lbx2Q9WUN8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lbx2Q9WUN8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lbx2Q9WUN8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lbx2Q9WUN8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lbx2Q9WUN8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Lbx2Q9WUN8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lbx2Q9WUN8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lbx2Q9WUN8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lbx2Q9WUN8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lbx2Q9WUN8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lbx2Q9WUN8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lbx2Q9WUN8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lbx2Q9WUN8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lbx2Q9WUN8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lbx2Q9WUN8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lbx2Q9WUN8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lbx2Q9WUN8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lbx2Q9WUN8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lbx2Q9WUN8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lbx2Q9WUN8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lbx2Q9WUN8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lbx2Q9WUN8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lbx2Q9WUN8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lbx2Q9WUN8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lbx2Q9WUN8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lbx2Q9WUN8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lbx2Q9WUN8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lbx2Q9WUN8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lbx2Q9WUN8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Lbx2Q9WUN8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lbx2Q9WUN8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lbx2Q9WUN8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lbx2Q9WUN8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lbx2Q9WUN8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lbx2Q9WUN8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lbx2Q9WUN8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lbx2Q9WUN8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lbx2Q9WUN8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lbx2Q9WUN8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lbx2Q9WUN8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lbx2Q9WUN8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lbx2Q9WUN8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lbx2Q9WUN8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lbx2Q9WUN8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lbx2Q9WUN8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lbx2Q9WUN8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lbx2Q9WUN8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lbx2Q9WUN8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Lbx2Q9WUN8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lbx2Q9WUN8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lbx2Q9WUN8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lbx2Q9WUN8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lbx2Q9WUN8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lbx2Q9WUN8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lbx2Q9WUN8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lbx2Q9WUN8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms