Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUI0

Mixl1, Homeobox protein MIXL1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mixl1Q9WUI0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mixl1Q9WUI0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mixl1Q9WUI0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mixl1Q9WUI0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mixl1Q9WUI0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mixl1Q9WUI0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mixl1Q9WUI0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mixl1Q9WUI0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Mixl1Q9WUI0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mixl1Q9WUI0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mixl1Q9WUI0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mixl1Q9WUI0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mixl1Q9WUI0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mixl1Q9WUI0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mixl1Q9WUI0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mixl1Q9WUI0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mixl1Q9WUI0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mixl1Q9WUI0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mixl1Q9WUI0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mixl1Q9WUI0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mixl1Q9WUI0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mixl1Q9WUI0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mixl1Q9WUI0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mixl1Q9WUI0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mixl1Q9WUI0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mixl1Q9WUI0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mixl1Q9WUI0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mixl1Q9WUI0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mixl1Q9WUI0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mixl1Q9WUI0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mixl1Q9WUI0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mixl1Q9WUI0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mixl1Q9WUI0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mixl1Q9WUI0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mixl1Q9WUI0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mixl1Q9WUI0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mixl1Q9WUI0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mixl1Q9WUI0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mixl1Q9WUI0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mixl1Q9WUI0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mixl1Q9WUI0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mixl1Q9WUI0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mixl1Q9WUI0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mixl1Q9WUI0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mixl1Q9WUI0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mixl1Q9WUI0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mixl1Q9WUI0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mixl1Q9WUI0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mixl1Q9WUI0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms