Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus1Q9WU56 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus1Q9WU56 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus1Q9WU56 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus1Q9WU56 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus1Q9WU56 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus1Q9WU56 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus1Q9WU56 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus1Q9WU56 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus1Q9WU56 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus1Q9WU56 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus1Q9WU56 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus1Q9WU56 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus1Q9WU56 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus1Q9WU56 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus1Q9WU56 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus1Q9WU56 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus1Q9WU56 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus1Q9WU56 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus1Q9WU56 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus1Q9WU56 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pus1Q9WU56 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pus1Q9WU56 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms