Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX6

Cul1, Cullin-1, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul1Q9WTX6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cul1Q9WTX6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cul1Q9WTX6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cul1Q9WTX6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cul1Q9WTX6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cul1Q9WTX6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul1Q9WTX6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul1Q9WTX6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cul1Q9WTX6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cul1Q9WTX6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cul1Q9WTX6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cul1Q9WTX6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cul1Q9WTX6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cul1Q9WTX6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cul1Q9WTX6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cul1Q9WTX6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cul1Q9WTX6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cul1Q9WTX6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cul1Q9WTX6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cul1Q9WTX6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cul1Q9WTX6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cul1Q9WTX6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cul1Q9WTX6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cul1Q9WTX6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cul1Q9WTX6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cul1Q9WTX6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cul1Q9WTX6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cul1Q9WTX6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul1Q9WTX6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul1Q9WTX6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul1Q9WTX6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul1Q9WTX6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul1Q9WTX6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul1Q9WTX6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul1Q9WTX6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul1Q9WTX6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul1Q9WTX6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul1Q9WTX6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul1Q9WTX6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul1Q9WTX6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms