Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema6cQ9WTM3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema6cQ9WTM3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema6cQ9WTM3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema6cQ9WTM3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema6cQ9WTM3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema6cQ9WTM3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema6cQ9WTM3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema6cQ9WTM3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema6cQ9WTM3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema6cQ9WTM3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema6cQ9WTM3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema6cQ9WTM3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema6cQ9WTM3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema6cQ9WTM3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema6cQ9WTM3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema6cQ9WTM3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema6cQ9WTM3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema6cQ9WTM3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema6cQ9WTM3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema6cQ9WTM3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema6cQ9WTM3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema6cQ9WTM3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema6cQ9WTM3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema6cQ9WTM3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema6cQ9WTM3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema6cQ9WTM3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema6cQ9WTM3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema6cQ9WTM3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema6cQ9WTM3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema6cQ9WTM3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sema6cQ9WTM3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sema6cQ9WTM3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sema6cQ9WTM3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema6cQ9WTM3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sema6cQ9WTM3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema6cQ9WTM3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema6cQ9WTM3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sema6cQ9WTM3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sema6cQ9WTM3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema6cQ9WTM3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema6cQ9WTM3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema6cQ9WTM3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema6cQ9WTM3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sema6cQ9WTM3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema6cQ9WTM3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema6cQ9WTM3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema6cQ9WTM3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema6cQ9WTM3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sema6cQ9WTM3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sema6cQ9WTM3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema6cQ9WTM3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sema6cQ9WTM3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema6cQ9WTM3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema6cQ9WTM3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema6cQ9WTM3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema6cQ9WTM3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema6cQ9WTM3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema6cQ9WTM3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sema6cQ9WTM3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema6cQ9WTM3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms