Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Fam50bQ9WTJ8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Fam50bQ9WTJ8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Fam50bQ9WTJ8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Fam50bQ9WTJ8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Fam50bQ9WTJ8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Fam50bQ9WTJ8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Fam50bQ9WTJ8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Fam50bQ9WTJ8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Fam50bQ9WTJ8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Fam50bQ9WTJ8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Fam50bQ9WTJ8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Fam50bQ9WTJ8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Fam50bQ9WTJ8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Fam50bQ9WTJ8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Fam50bQ9WTJ8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Fam50bQ9WTJ8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Fam50bQ9WTJ8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Fam50bQ9WTJ8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Fam50bQ9WTJ8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Fam50bQ9WTJ8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Fam50bQ9WTJ8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Fam50bQ9WTJ8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Fam50bQ9WTJ8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Fam50bQ9WTJ8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Fam50bQ9WTJ8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Fam50bQ9WTJ8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Fam50bQ9WTJ8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Fam50bQ9WTJ8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Fam50bQ9WTJ8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Fam50bQ9WTJ8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Fam50bQ9WTJ8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Fam50bQ9WTJ8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Fam50bQ9WTJ8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Fam50bQ9WTJ8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Fam50bQ9WTJ8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Fam50bQ9WTJ8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Fam50bQ9WTJ8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Fam50bQ9WTJ8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fam50bQ9WTJ8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fam50bQ9WTJ8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fam50bQ9WTJ8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fam50bQ9WTJ8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fam50bQ9WTJ8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Fam50bQ9WTJ8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Fam50bQ9WTJ8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Fam50bQ9WTJ8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Fam50bQ9WTJ8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Fam50bQ9WTJ8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Fam50bQ9WTJ8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Fam50bQ9WTJ8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Fam50bQ9WTJ8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Fam50bQ9WTJ8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Fam50bQ9WTJ8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Fam50bQ9WTJ8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Fam50bQ9WTJ8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Fam50bQ9WTJ8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Fam50bQ9WTJ8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Fam50bQ9WTJ8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Fam50bQ9WTJ8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Fam50bQ9WTJ8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Fam50bQ9WTJ8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Fam50bQ9WTJ8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Fam50bQ9WTJ8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Fam50bQ9WTJ8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Fam50bQ9WTJ8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Fam50bQ9WTJ8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Fam50bQ9WTJ8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Fam50bQ9WTJ8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Fam50bQ9WTJ8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fam50bQ9WTJ8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fam50bQ9WTJ8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Fam50bQ9WTJ8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fam50bQ9WTJ8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fam50bQ9WTJ8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fam50bQ9WTJ8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fam50bQ9WTJ8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fam50bQ9WTJ8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Fam50bQ9WTJ8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Fam50bQ9WTJ8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Fam50bQ9WTJ8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fam50bQ9WTJ8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fam50bQ9WTJ8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Fam50bQ9WTJ8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Fam50bQ9WTJ8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Fam50bQ9WTJ8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Fam50bQ9WTJ8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Fam50bQ9WTJ8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Fam50bQ9WTJ8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fam50bQ9WTJ8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fam50bQ9WTJ8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fam50bQ9WTJ8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Fam50bQ9WTJ8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Fam50bQ9WTJ8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Fam50bQ9WTJ8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Fam50bQ9WTJ8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fam50bQ9WTJ8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Fam50bQ9WTJ8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fam50bQ9WTJ8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fam50bQ9WTJ8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms