Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psmb3Q9R1P1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psmb3Q9R1P1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb3Q9R1P1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb3Q9R1P1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb3Q9R1P1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb3Q9R1P1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb3Q9R1P1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb3Q9R1P1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb3Q9R1P1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb3Q9R1P1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb3Q9R1P1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Psmb3Q9R1P1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psmb3Q9R1P1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psmb3Q9R1P1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psmb3Q9R1P1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psmb3Q9R1P1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb3Q9R1P1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb3Q9R1P1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb3Q9R1P1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb3Q9R1P1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb3Q9R1P1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb3Q9R1P1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb3Q9R1P1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb3Q9R1P1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb3Q9R1P1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb3Q9R1P1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb3Q9R1P1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb3Q9R1P1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb3Q9R1P1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb3Q9R1P1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb3Q9R1P1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb3Q9R1P1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmb3Q9R1P1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms