Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ercc4Q9QZD4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ercc4Q9QZD4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ercc4Q9QZD4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ercc4Q9QZD4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ercc4Q9QZD4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ercc4Q9QZD4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ercc4Q9QZD4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ercc4Q9QZD4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ercc4Q9QZD4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ercc4Q9QZD4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ercc4Q9QZD4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ercc4Q9QZD4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ercc4Q9QZD4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ercc4Q9QZD4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ercc4Q9QZD4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ercc4Q9QZD4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ercc4Q9QZD4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ercc4Q9QZD4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ercc4Q9QZD4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ercc4Q9QZD4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ercc4Q9QZD4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ercc4Q9QZD4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ercc4Q9QZD4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ercc4Q9QZD4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ercc4Q9QZD4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ercc4Q9QZD4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ercc4Q9QZD4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ercc4Q9QZD4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ercc4Q9QZD4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ercc4Q9QZD4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ercc4Q9QZD4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ercc4Q9QZD4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ercc4Q9QZD4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ercc4Q9QZD4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ercc4Q9QZD4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ercc4Q9QZD4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ercc4Q9QZD4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ercc4Q9QZD4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ercc4Q9QZD4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ercc4Q9QZD4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ercc4Q9QZD4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ercc4Q9QZD4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ercc4Q9QZD4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ercc4Q9QZD4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ercc4Q9QZD4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ercc4Q9QZD4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ercc4Q9QZD4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ercc4Q9QZD4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ercc4Q9QZD4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ercc4Q9QZD4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ercc4Q9QZD4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ercc4Q9QZD4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ercc4Q9QZD4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ercc4Q9QZD4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ercc4Q9QZD4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ercc4Q9QZD4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ercc4Q9QZD4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ercc4Q9QZD4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ercc4Q9QZD4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ercc4Q9QZD4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc4Q9QZD4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc4Q9QZD4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc4Q9QZD4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc4Q9QZD4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc4Q9QZD4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc4Q9QZD4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc4Q9QZD4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc4Q9QZD4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc4Q9QZD4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc4Q9QZD4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc4Q9QZD4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc4Q9QZD4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ercc4Q9QZD4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ercc4Q9QZD4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ercc4Q9QZD4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ercc4Q9QZD4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ercc4Q9QZD4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ercc4Q9QZD4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ercc4Q9QZD4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ercc4Q9QZD4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ercc4Q9QZD4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ercc4Q9QZD4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ercc4Q9QZD4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ercc4Q9QZD4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ercc4Q9QZD4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ercc4Q9QZD4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ercc4Q9QZD4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ercc4Q9QZD4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ercc4Q9QZD4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ercc4Q9QZD4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ercc4Q9QZD4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ercc4Q9QZD4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ercc4Q9QZD4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ercc4Q9QZD4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ercc4Q9QZD4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ercc4Q9QZD4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ercc4Q9QZD4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ercc4Q9QZD4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ercc4Q9QZD4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms