Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Irx4Q9QY61 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Irx4Q9QY61 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Irx4Q9QY61 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irx4Q9QY61 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irx4Q9QY61 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irx4Q9QY61 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irx4Q9QY61 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Irx4Q9QY61 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irx4Q9QY61 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Irx4Q9QY61 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Irx4Q9QY61 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Irx4Q9QY61 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Irx4Q9QY61 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Irx4Q9QY61 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Irx4Q9QY61 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Irx4Q9QY61 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Irx4Q9QY61 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Irx4Q9QY61 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Irx4Q9QY61 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Irx4Q9QY61 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Irx4Q9QY61 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Irx4Q9QY61 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Irx4Q9QY61 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Irx4Q9QY61 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Irx4Q9QY61 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Irx4Q9QY61 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx4Q9QY61 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx4Q9QY61 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx4Q9QY61 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx4Q9QY61 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx4Q9QY61 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irx4Q9QY61 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irx4Q9QY61 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Irx4Q9QY61 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Irx4Q9QY61 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Irx4Q9QY61 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Irx4Q9QY61 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irx4Q9QY61 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irx4Q9QY61 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irx4Q9QY61 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irx4Q9QY61 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Irx4Q9QY61 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Irx4Q9QY61 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx4Q9QY61 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx4Q9QY61 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx4Q9QY61 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx4Q9QY61 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx4Q9QY61 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx4Q9QY61 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx4Q9QY61 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx4Q9QY61 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx4Q9QY61 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx4Q9QY61 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx4Q9QY61 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx4Q9QY61 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx4Q9QY61 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx4Q9QY61 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx4Q9QY61 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx4Q9QY61 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx4Q9QY61 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx4Q9QY61 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx4Q9QY61 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx4Q9QY61 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx4Q9QY61 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx4Q9QY61 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irx4Q9QY61 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irx4Q9QY61 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irx4Q9QY61 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irx4Q9QY61 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx4Q9QY61 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx4Q9QY61 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx4Q9QY61 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irx4Q9QY61 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irx4Q9QY61 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irx4Q9QY61 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irx4Q9QY61 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irx4Q9QY61 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irx4Q9QY61 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irx4Q9QY61 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irx4Q9QY61 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irx4Q9QY61 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irx4Q9QY61 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irx4Q9QY61 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irx4Q9QY61 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irx4Q9QY61 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irx4Q9QY61 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irx4Q9QY61 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irx4Q9QY61 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irx4Q9QY61 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irx4Q9QY61 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irx4Q9QY61 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irx4Q9QY61 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irx4Q9QY61 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irx4Q9QY61 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irx4Q9QY61 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irx4Q9QY61 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irx4Q9QY61 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irx4Q9QY61 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irx4Q9QY61 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms