Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nr2e3Q9QXZ7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nr2e3Q9QXZ7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nr2e3Q9QXZ7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nr2e3Q9QXZ7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nr2e3Q9QXZ7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nr2e3Q9QXZ7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nr2e3Q9QXZ7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nr2e3Q9QXZ7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nr2e3Q9QXZ7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nr2e3Q9QXZ7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nr2e3Q9QXZ7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nr2e3Q9QXZ7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nr2e3Q9QXZ7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nr2e3Q9QXZ7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nr2e3Q9QXZ7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nr2e3Q9QXZ7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nr2e3Q9QXZ7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nr2e3Q9QXZ7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nr2e3Q9QXZ7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nr2e3Q9QXZ7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nr2e3Q9QXZ7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Nr2e3Q9QXZ7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Nr2e3Q9QXZ7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nr2e3Q9QXZ7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nr2e3Q9QXZ7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nr2e3Q9QXZ7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nr2e3Q9QXZ7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nr2e3Q9QXZ7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nr2e3Q9QXZ7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nr2e3Q9QXZ7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nr2e3Q9QXZ7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nr2e3Q9QXZ7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nr2e3Q9QXZ7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nr2e3Q9QXZ7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nr2e3Q9QXZ7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nr2e3Q9QXZ7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Nr2e3Q9QXZ7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nr2e3Q9QXZ7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Nr2e3Q9QXZ7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nr2e3Q9QXZ7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nr2e3Q9QXZ7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nr2e3Q9QXZ7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nr2e3Q9QXZ7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nr2e3Q9QXZ7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nr2e3Q9QXZ7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nr2e3Q9QXZ7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nr2e3Q9QXZ7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nr2e3Q9QXZ7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nr2e3Q9QXZ7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nr2e3Q9QXZ7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nr2e3Q9QXZ7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nr2e3Q9QXZ7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nr2e3Q9QXZ7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nr2e3Q9QXZ7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Nr2e3Q9QXZ7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nr2e3Q9QXZ7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nr2e3Q9QXZ7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nr2e3Q9QXZ7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nr2e3Q9QXZ7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Nr2e3Q9QXZ7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nr2e3Q9QXZ7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nr2e3Q9QXZ7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Nr2e3Q9QXZ7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nr2e3Q9QXZ7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nr2e3Q9QXZ7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nr2e3Q9QXZ7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nr2e3Q9QXZ7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nr2e3Q9QXZ7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nr2e3Q9QXZ7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nr2e3Q9QXZ7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nr2e3Q9QXZ7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nr2e3Q9QXZ7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nr2e3Q9QXZ7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nr2e3Q9QXZ7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nr2e3Q9QXZ7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nr2e3Q9QXZ7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms