Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcsk1nQ9QXV0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcsk1nQ9QXV0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcsk1nQ9QXV0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcsk1nQ9QXV0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcsk1nQ9QXV0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcsk1nQ9QXV0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcsk1nQ9QXV0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcsk1nQ9QXV0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcsk1nQ9QXV0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcsk1nQ9QXV0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcsk1nQ9QXV0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcsk1nQ9QXV0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcsk1nQ9QXV0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcsk1nQ9QXV0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcsk1nQ9QXV0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcsk1nQ9QXV0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcsk1nQ9QXV0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcsk1nQ9QXV0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcsk1nQ9QXV0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcsk1nQ9QXV0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcsk1nQ9QXV0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcsk1nQ9QXV0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcsk1nQ9QXV0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcsk1nQ9QXV0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcsk1nQ9QXV0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcsk1nQ9QXV0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcsk1nQ9QXV0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcsk1nQ9QXV0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcsk1nQ9QXV0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcsk1nQ9QXV0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcsk1nQ9QXV0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcsk1nQ9QXV0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcsk1nQ9QXV0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcsk1nQ9QXV0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcsk1nQ9QXV0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcsk1nQ9QXV0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcsk1nQ9QXV0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcsk1nQ9QXV0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcsk1nQ9QXV0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcsk1nQ9QXV0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcsk1nQ9QXV0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcsk1nQ9QXV0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcsk1nQ9QXV0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcsk1nQ9QXV0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcsk1nQ9QXV0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcsk1nQ9QXV0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcsk1nQ9QXV0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcsk1nQ9QXV0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcsk1nQ9QXV0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcsk1nQ9QXV0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcsk1nQ9QXV0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcsk1nQ9QXV0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcsk1nQ9QXV0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcsk1nQ9QXV0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcsk1nQ9QXV0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcsk1nQ9QXV0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcsk1nQ9QXV0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcsk1nQ9QXV0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcsk1nQ9QXV0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pcsk1nQ9QXV0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcsk1nQ9QXV0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcsk1nQ9QXV0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcsk1nQ9QXV0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcsk1nQ9QXV0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcsk1nQ9QXV0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcsk1nQ9QXV0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcsk1nQ9QXV0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcsk1nQ9QXV0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcsk1nQ9QXV0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcsk1nQ9QXV0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcsk1nQ9QXV0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcsk1nQ9QXV0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcsk1nQ9QXV0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcsk1nQ9QXV0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcsk1nQ9QXV0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcsk1nQ9QXV0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcsk1nQ9QXV0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcsk1nQ9QXV0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcsk1nQ9QXV0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcsk1nQ9QXV0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcsk1nQ9QXV0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcsk1nQ9QXV0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcsk1nQ9QXV0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcsk1nQ9QXV0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcsk1nQ9QXV0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcsk1nQ9QXV0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcsk1nQ9QXV0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcsk1nQ9QXV0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms