Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lsm4Q9QXA5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms