Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWL7

Krt17, Keratin, type I cytoskeletal 17, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt17Q9QWL7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt17Q9QWL7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt17Q9QWL7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt17Q9QWL7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt17Q9QWL7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt17Q9QWL7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt17Q9QWL7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt17Q9QWL7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt17Q9QWL7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt17Q9QWL7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt17Q9QWL7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt17Q9QWL7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt17Q9QWL7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt17Q9QWL7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt17Q9QWL7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt17Q9QWL7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt17Q9QWL7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt17Q9QWL7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt17Q9QWL7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Krt17Q9QWL7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Krt17Q9QWL7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt17Q9QWL7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt17Q9QWL7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt17Q9QWL7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt17Q9QWL7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt17Q9QWL7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt17Q9QWL7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt17Q9QWL7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt17Q9QWL7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt17Q9QWL7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt17Q9QWL7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt17Q9QWL7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt17Q9QWL7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt17Q9QWL7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt17Q9QWL7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt17Q9QWL7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Krt17Q9QWL7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt17Q9QWL7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt17Q9QWL7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt17Q9QWL7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt17Q9QWL7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt17Q9QWL7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt17Q9QWL7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt17Q9QWL7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt17Q9QWL7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt17Q9QWL7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt17Q9QWL7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt17Q9QWL7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt17Q9QWL7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt17Q9QWL7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt17Q9QWL7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt17Q9QWL7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt17Q9QWL7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt17Q9QWL7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt17Q9QWL7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt17Q9QWL7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt17Q9QWL7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt17Q9QWL7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt17Q9QWL7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt17Q9QWL7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt17Q9QWL7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt17Q9QWL7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt17Q9QWL7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt17Q9QWL7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt17Q9QWL7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt17Q9QWL7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt17Q9QWL7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt17Q9QWL7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt17Q9QWL7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt17Q9QWL7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt17Q9QWL7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt17Q9QWL7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt17Q9QWL7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt17Q9QWL7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt17Q9QWL7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt17Q9QWL7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt17Q9QWL7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt17Q9QWL7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt17Q9QWL7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt17Q9QWL7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt17Q9QWL7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt17Q9QWL7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt17Q9QWL7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt17Q9QWL7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Krt17Q9QWL7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Krt17Q9QWL7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt17Q9QWL7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt17Q9QWL7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt17Q9QWL7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt17Q9QWL7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt17Q9QWL7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt17Q9QWL7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt17Q9QWL7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt17Q9QWL7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt17Q9QWL7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt17Q9QWL7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt17Q9QWL7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt17Q9QWL7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt17Q9QWL7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt17Q9QWL7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms