Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rabgef1Q9JM13 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rabgef1Q9JM13 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rabgef1Q9JM13 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rabgef1Q9JM13 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rabgef1Q9JM13 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rabgef1Q9JM13 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rabgef1Q9JM13 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rabgef1Q9JM13 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rabgef1Q9JM13 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rabgef1Q9JM13 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rabgef1Q9JM13 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rabgef1Q9JM13 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rabgef1Q9JM13 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rabgef1Q9JM13 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rabgef1Q9JM13 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rabgef1Q9JM13 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rabgef1Q9JM13 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rabgef1Q9JM13 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rabgef1Q9JM13 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rabgef1Q9JM13 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rabgef1Q9JM13 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rabgef1Q9JM13 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rabgef1Q9JM13 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rabgef1Q9JM13 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rabgef1Q9JM13 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rabgef1Q9JM13 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rabgef1Q9JM13 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rabgef1Q9JM13 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rabgef1Q9JM13 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rabgef1Q9JM13 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rabgef1Q9JM13 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rabgef1Q9JM13 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rabgef1Q9JM13 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rabgef1Q9JM13 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rabgef1Q9JM13 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rabgef1Q9JM13 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rabgef1Q9JM13 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rabgef1Q9JM13 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rabgef1Q9JM13 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rabgef1Q9JM13 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rabgef1Q9JM13 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rabgef1Q9JM13 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rabgef1Q9JM13 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rabgef1Q9JM13 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rabgef1Q9JM13 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rabgef1Q9JM13 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rabgef1Q9JM13 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rabgef1Q9JM13 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rabgef1Q9JM13 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rabgef1Q9JM13 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rabgef1Q9JM13 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rabgef1Q9JM13 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rabgef1Q9JM13 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rabgef1Q9JM13 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rabgef1Q9JM13 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rabgef1Q9JM13 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rabgef1Q9JM13 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rabgef1Q9JM13 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rabgef1Q9JM13 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rabgef1Q9JM13 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rabgef1Q9JM13 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rabgef1Q9JM13 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rabgef1Q9JM13 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rabgef1Q9JM13 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rabgef1Q9JM13 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rabgef1Q9JM13 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rabgef1Q9JM13 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rabgef1Q9JM13 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rabgef1Q9JM13 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rabgef1Q9JM13 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rabgef1Q9JM13 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rabgef1Q9JM13 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rabgef1Q9JM13 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rabgef1Q9JM13 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rabgef1Q9JM13 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rabgef1Q9JM13 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rabgef1Q9JM13 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rabgef1Q9JM13 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rabgef1Q9JM13 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rabgef1Q9JM13 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rabgef1Q9JM13 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rabgef1Q9JM13 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rabgef1Q9JM13 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rabgef1Q9JM13 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rabgef1Q9JM13 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rabgef1Q9JM13 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rabgef1Q9JM13 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rabgef1Q9JM13 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rabgef1Q9JM13 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rabgef1Q9JM13 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rabgef1Q9JM13 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rabgef1Q9JM13 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
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