Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmod4Q9JLH8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmod4Q9JLH8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmod4Q9JLH8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmod4Q9JLH8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmod4Q9JLH8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmod4Q9JLH8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmod4Q9JLH8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmod4Q9JLH8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmod4Q9JLH8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmod4Q9JLH8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmod4Q9JLH8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmod4Q9JLH8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmod4Q9JLH8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmod4Q9JLH8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmod4Q9JLH8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmod4Q9JLH8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmod4Q9JLH8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmod4Q9JLH8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmod4Q9JLH8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmod4Q9JLH8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmod4Q9JLH8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmod4Q9JLH8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmod4Q9JLH8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmod4Q9JLH8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmod4Q9JLH8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmod4Q9JLH8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmod4Q9JLH8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmod4Q9JLH8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmod4Q9JLH8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmod4Q9JLH8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmod4Q9JLH8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Tmod4Q9JLH8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Tmod4Q9JLH8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tmod4Q9JLH8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tmod4Q9JLH8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tmod4Q9JLH8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmod4Q9JLH8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmod4Q9JLH8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmod4Q9JLH8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmod4Q9JLH8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmod4Q9JLH8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmod4Q9JLH8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmod4Q9JLH8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmod4Q9JLH8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmod4Q9JLH8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tmod4Q9JLH8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tmod4Q9JLH8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tmod4Q9JLH8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tmod4Q9JLH8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tmod4Q9JLH8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tmod4Q9JLH8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tmod4Q9JLH8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmod4Q9JLH8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmod4Q9JLH8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmod4Q9JLH8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmod4Q9JLH8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmod4Q9JLH8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmod4Q9JLH8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmod4Q9JLH8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmod4Q9JLH8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmod4Q9JLH8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tmod4Q9JLH8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tmod4Q9JLH8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmod4Q9JLH8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmod4Q9JLH8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmod4Q9JLH8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmod4Q9JLH8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmod4Q9JLH8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmod4Q9JLH8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmod4Q9JLH8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmod4Q9JLH8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmod4Q9JLH8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmod4Q9JLH8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmod4Q9JLH8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmod4Q9JLH8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmod4Q9JLH8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmod4Q9JLH8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmod4Q9JLH8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmod4Q9JLH8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmod4Q9JLH8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmod4Q9JLH8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmod4Q9JLH8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmod4Q9JLH8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmod4Q9JLH8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmod4Q9JLH8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmod4Q9JLH8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmod4Q9JLH8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmod4Q9JLH8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmod4Q9JLH8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmod4Q9JLH8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmod4Q9JLH8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmod4Q9JLH8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmod4Q9JLH8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmod4Q9JLH8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmod4Q9JLH8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmod4Q9JLH8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmod4Q9JLH8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmod4Q9JLH8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmod4Q9JLH8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
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