Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx5Q9JKQ4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx5Q9JKQ4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx5Q9JKQ4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irx5Q9JKQ4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irx5Q9JKQ4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irx5Q9JKQ4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irx5Q9JKQ4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irx5Q9JKQ4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irx5Q9JKQ4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irx5Q9JKQ4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irx5Q9JKQ4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irx5Q9JKQ4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irx5Q9JKQ4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irx5Q9JKQ4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irx5Q9JKQ4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irx5Q9JKQ4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irx5Q9JKQ4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irx5Q9JKQ4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irx5Q9JKQ4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Irx5Q9JKQ4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Irx5Q9JKQ4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Irx5Q9JKQ4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Irx5Q9JKQ4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Irx5Q9JKQ4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irx5Q9JKQ4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irx5Q9JKQ4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Irx5Q9JKQ4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irx5Q9JKQ4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Irx5Q9JKQ4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Irx5Q9JKQ4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irx5Q9JKQ4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irx5Q9JKQ4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irx5Q9JKQ4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irx5Q9JKQ4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Irx5Q9JKQ4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irx5Q9JKQ4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irx5Q9JKQ4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irx5Q9JKQ4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Irx5Q9JKQ4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Irx5Q9JKQ4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irx5Q9JKQ4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx5Q9JKQ4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx5Q9JKQ4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx5Q9JKQ4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx5Q9JKQ4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Irx5Q9JKQ4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Irx5Q9JKQ4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Irx5Q9JKQ4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Irx5Q9JKQ4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Irx5Q9JKQ4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irx5Q9JKQ4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irx5Q9JKQ4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irx5Q9JKQ4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irx5Q9JKQ4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irx5Q9JKQ4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx5Q9JKQ4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx5Q9JKQ4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx5Q9JKQ4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx5Q9JKQ4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx5Q9JKQ4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx5Q9JKQ4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irx5Q9JKQ4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irx5Q9JKQ4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irx5Q9JKQ4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx5Q9JKQ4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx5Q9JKQ4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx5Q9JKQ4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx5Q9JKQ4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx5Q9JKQ4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Irx5Q9JKQ4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Irx5Q9JKQ4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Irx5Q9JKQ4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irx5Q9JKQ4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irx5Q9JKQ4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irx5Q9JKQ4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irx5Q9JKQ4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irx5Q9JKQ4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Irx5Q9JKQ4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Irx5Q9JKQ4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Irx5Q9JKQ4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Irx5Q9JKQ4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Irx5Q9JKQ4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Irx5Q9JKQ4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irx5Q9JKQ4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irx5Q9JKQ4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irx5Q9JKQ4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irx5Q9JKQ4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irx5Q9JKQ4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irx5Q9JKQ4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irx5Q9JKQ4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irx5Q9JKQ4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irx5Q9JKQ4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Irx5Q9JKQ4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Irx5Q9JKQ4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Irx5Q9JKQ4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Irx5Q9JKQ4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Irx5Q9JKQ4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Irx5Q9JKQ4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Irx5Q9JKQ4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms