Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trem1Q9JKE2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trem1Q9JKE2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trem1Q9JKE2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trem1Q9JKE2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trem1Q9JKE2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trem1Q9JKE2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trem1Q9JKE2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trem1Q9JKE2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trem1Q9JKE2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trem1Q9JKE2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trem1Q9JKE2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trem1Q9JKE2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trem1Q9JKE2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trem1Q9JKE2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trem1Q9JKE2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trem1Q9JKE2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trem1Q9JKE2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trem1Q9JKE2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trem1Q9JKE2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trem1Q9JKE2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trem1Q9JKE2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trem1Q9JKE2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trem1Q9JKE2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trem1Q9JKE2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trem1Q9JKE2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trem1Q9JKE2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trem1Q9JKE2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trem1Q9JKE2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trem1Q9JKE2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trem1Q9JKE2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trem1Q9JKE2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trem1Q9JKE2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trem1Q9JKE2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trem1Q9JKE2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trem1Q9JKE2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trem1Q9JKE2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trem1Q9JKE2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trem1Q9JKE2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trem1Q9JKE2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trem1Q9JKE2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trem1Q9JKE2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trem1Q9JKE2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trem1Q9JKE2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trem1Q9JKE2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trem1Q9JKE2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trem1Q9JKE2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trem1Q9JKE2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trem1Q9JKE2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trem1Q9JKE2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trem1Q9JKE2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trem1Q9JKE2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trem1Q9JKE2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trem1Q9JKE2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trem1Q9JKE2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trem1Q9JKE2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trem1Q9JKE2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trem1Q9JKE2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trem1Q9JKE2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trem1Q9JKE2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trem1Q9JKE2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trem1Q9JKE2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trem1Q9JKE2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trem1Q9JKE2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trem1Q9JKE2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trem1Q9JKE2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trem1Q9JKE2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trem1Q9JKE2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trem1Q9JKE2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trem1Q9JKE2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trem1Q9JKE2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trem1Q9JKE2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trem1Q9JKE2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trem1Q9JKE2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trem1Q9JKE2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trem1Q9JKE2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trem1Q9JKE2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trem1Q9JKE2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trem1Q9JKE2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trem1Q9JKE2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trem1Q9JKE2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trem1Q9JKE2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trem1Q9JKE2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trem1Q9JKE2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trem1Q9JKE2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trem1Q9JKE2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trem1Q9JKE2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trem1Q9JKE2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trem1Q9JKE2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trem1Q9JKE2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms