Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scamp5Q9JKD3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scamp5Q9JKD3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scamp5Q9JKD3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scamp5Q9JKD3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scamp5Q9JKD3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scamp5Q9JKD3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scamp5Q9JKD3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scamp5Q9JKD3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scamp5Q9JKD3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scamp5Q9JKD3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scamp5Q9JKD3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scamp5Q9JKD3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scamp5Q9JKD3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scamp5Q9JKD3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scamp5Q9JKD3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scamp5Q9JKD3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scamp5Q9JKD3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scamp5Q9JKD3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scamp5Q9JKD3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scamp5Q9JKD3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scamp5Q9JKD3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scamp5Q9JKD3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scamp5Q9JKD3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scamp5Q9JKD3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scamp5Q9JKD3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scamp5Q9JKD3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Scamp5Q9JKD3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scamp5Q9JKD3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scamp5Q9JKD3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scamp5Q9JKD3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scamp5Q9JKD3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scamp5Q9JKD3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scamp5Q9JKD3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scamp5Q9JKD3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scamp5Q9JKD3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scamp5Q9JKD3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scamp5Q9JKD3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scamp5Q9JKD3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scamp5Q9JKD3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scamp5Q9JKD3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scamp5Q9JKD3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scamp5Q9JKD3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scamp5Q9JKD3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scamp5Q9JKD3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scamp5Q9JKD3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scamp5Q9JKD3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Scamp5Q9JKD3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scamp5Q9JKD3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Scamp5Q9JKD3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scamp5Q9JKD3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scamp5Q9JKD3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scamp5Q9JKD3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scamp5Q9JKD3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scamp5Q9JKD3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Scamp5Q9JKD3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scamp5Q9JKD3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scamp5Q9JKD3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scamp5Q9JKD3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scamp5Q9JKD3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scamp5Q9JKD3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scamp5Q9JKD3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scamp5Q9JKD3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scamp5Q9JKD3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scamp5Q9JKD3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Scamp5Q9JKD3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scamp5Q9JKD3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.7 ms