Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bco1Q9JJS6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bco1Q9JJS6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bco1Q9JJS6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Bco1Q9JJS6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Bco1Q9JJS6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Bco1Q9JJS6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bco1Q9JJS6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bco1Q9JJS6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bco1Q9JJS6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bco1Q9JJS6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bco1Q9JJS6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bco1Q9JJS6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bco1Q9JJS6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bco1Q9JJS6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bco1Q9JJS6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bco1Q9JJS6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bco1Q9JJS6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bco1Q9JJS6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bco1Q9JJS6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bco1Q9JJS6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bco1Q9JJS6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bco1Q9JJS6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bco1Q9JJS6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bco1Q9JJS6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bco1Q9JJS6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bco1Q9JJS6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bco1Q9JJS6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bco1Q9JJS6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bco1Q9JJS6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bco1Q9JJS6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bco1Q9JJS6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
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Bco1Q9JJS6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bco1Q9JJS6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bco1Q9JJS6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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