Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfhx4Q9JJN2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfhx4Q9JJN2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfhx4Q9JJN2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfhx4Q9JJN2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfhx4Q9JJN2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zfhx4Q9JJN2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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