Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc22Q9JIG7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc22Q9JIG7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc22Q9JIG7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc22Q9JIG7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc22Q9JIG7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc22Q9JIG7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc22Q9JIG7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc22Q9JIG7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc22Q9JIG7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc22Q9JIG7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc22Q9JIG7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc22Q9JIG7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc22Q9JIG7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc22Q9JIG7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc22Q9JIG7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc22Q9JIG7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc22Q9JIG7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc22Q9JIG7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc22Q9JIG7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc22Q9JIG7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc22Q9JIG7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc22Q9JIG7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc22Q9JIG7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc22Q9JIG7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc22Q9JIG7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc22Q9JIG7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc22Q9JIG7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc22Q9JIG7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc22Q9JIG7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc22Q9JIG7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc22Q9JIG7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc22Q9JIG7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc22Q9JIG7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc22Q9JIG7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc22Q9JIG7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc22Q9JIG7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc22Q9JIG7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc22Q9JIG7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc22Q9JIG7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc22Q9JIG7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc22Q9JIG7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc22Q9JIG7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc22Q9JIG7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc22Q9JIG7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc22Q9JIG7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc22Q9JIG7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc22Q9JIG7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc22Q9JIG7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc22Q9JIG7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc22Q9JIG7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc22Q9JIG7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc22Q9JIG7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc22Q9JIG7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc22Q9JIG7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc22Q9JIG7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc22Q9JIG7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc22Q9JIG7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc22Q9JIG7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc22Q9JIG7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc22Q9JIG7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc22Q9JIG7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc22Q9JIG7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc22Q9JIG7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms