Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET37

Slc5a4a, Solute carrier family 5 member 4A, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4aQ9ET37 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc5a4aQ9ET37 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc5a4aQ9ET37 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc5a4aQ9ET37 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc5a4aQ9ET37 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc5a4aQ9ET37 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc5a4aQ9ET37 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc5a4aQ9ET37 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc5a4aQ9ET37 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc5a4aQ9ET37 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc5a4aQ9ET37 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc5a4aQ9ET37 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc5a4aQ9ET37 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc5a4aQ9ET37 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc5a4aQ9ET37 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc5a4aQ9ET37 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc5a4aQ9ET37 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Slc5a4aQ9ET37 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc5a4aQ9ET37 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc5a4aQ9ET37 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc5a4aQ9ET37 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc5a4aQ9ET37 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc5a4aQ9ET37 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc5a4aQ9ET37 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc5a4aQ9ET37 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc5a4aQ9ET37 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc5a4aQ9ET37 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc5a4aQ9ET37 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc5a4aQ9ET37 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc5a4aQ9ET37 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc5a4aQ9ET37 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc5a4aQ9ET37 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc5a4aQ9ET37 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc5a4aQ9ET37 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc5a4aQ9ET37 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc5a4aQ9ET37 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc5a4aQ9ET37 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc5a4aQ9ET37 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc5a4aQ9ET37 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc5a4aQ9ET37 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc5a4aQ9ET37 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc5a4aQ9ET37 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slc5a4aQ9ET37 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slc5a4aQ9ET37 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc5a4aQ9ET37 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc5a4aQ9ET37 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc5a4aQ9ET37 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc5a4aQ9ET37 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc5a4aQ9ET37 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc5a4aQ9ET37 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc5a4aQ9ET37 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc5a4aQ9ET37 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc5a4aQ9ET37 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc5a4aQ9ET37 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc5a4aQ9ET37 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc5a4aQ9ET37 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc5a4aQ9ET37 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc5a4aQ9ET37 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc5a4aQ9ET37 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc5a4aQ9ET37 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc5a4aQ9ET37 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc5a4aQ9ET37 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc5a4aQ9ET37 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc5a4aQ9ET37 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc5a4aQ9ET37 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc5a4aQ9ET37 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc5a4aQ9ET37 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc5a4aQ9ET37 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc5a4aQ9ET37 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc5a4aQ9ET37 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc5a4aQ9ET37 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc5a4aQ9ET37 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc5a4aQ9ET37 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc5a4aQ9ET37 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc5a4aQ9ET37 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc5a4aQ9ET37 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc5a4aQ9ET37 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc5a4aQ9ET37 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc5a4aQ9ET37 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc5a4aQ9ET37 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc5a4aQ9ET37 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc5a4aQ9ET37 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc5a4aQ9ET37 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc5a4aQ9ET37 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc5a4aQ9ET37 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc5a4aQ9ET37 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc5a4aQ9ET37 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc5a4aQ9ET37 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc5a4aQ9ET37 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc5a4aQ9ET37 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc5a4aQ9ET37 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc5a4aQ9ET37 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc5a4aQ9ET37 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc5a4aQ9ET37 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc5a4aQ9ET37 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc5a4aQ9ET37 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc5a4aQ9ET37 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc5a4aQ9ET37 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Slc5a4aQ9ET37 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Slc5a4aQ9ET37 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms