Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERV1

Mkrn2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn2Q9ERV1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mkrn2Q9ERV1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mkrn2Q9ERV1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mkrn2Q9ERV1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mkrn2Q9ERV1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Mkrn2Q9ERV1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mkrn2Q9ERV1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mkrn2Q9ERV1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mkrn2Q9ERV1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mkrn2Q9ERV1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mkrn2Q9ERV1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mkrn2Q9ERV1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mkrn2Q9ERV1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mkrn2Q9ERV1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mkrn2Q9ERV1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mkrn2Q9ERV1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mkrn2Q9ERV1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mkrn2Q9ERV1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mkrn2Q9ERV1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mkrn2Q9ERV1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mkrn2Q9ERV1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mkrn2Q9ERV1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mkrn2Q9ERV1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mkrn2Q9ERV1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mkrn2Q9ERV1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mkrn2Q9ERV1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mkrn2Q9ERV1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mkrn2Q9ERV1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mkrn2Q9ERV1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mkrn2Q9ERV1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mkrn2Q9ERV1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mkrn2Q9ERV1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mkrn2Q9ERV1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Mkrn2Q9ERV1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mkrn2Q9ERV1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mkrn2Q9ERV1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mkrn2Q9ERV1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Mkrn2Q9ERV1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mkrn2Q9ERV1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mkrn2Q9ERV1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mkrn2Q9ERV1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Mkrn2Q9ERV1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mkrn2Q9ERV1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mkrn2Q9ERV1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mkrn2Q9ERV1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mkrn2Q9ERV1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mkrn2Q9ERV1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mkrn2Q9ERV1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mkrn2Q9ERV1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mkrn2Q9ERV1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Mkrn2Q9ERV1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mkrn2Q9ERV1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mkrn2Q9ERV1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mkrn2Q9ERV1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mkrn2Q9ERV1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mkrn2Q9ERV1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mkrn2Q9ERV1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Mkrn2Q9ERV1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mkrn2Q9ERV1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mkrn2Q9ERV1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mkrn2Q9ERV1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mkrn2Q9ERV1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Mkrn2Q9ERV1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mkrn2Q9ERV1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mkrn2Q9ERV1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mkrn2Q9ERV1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mkrn2Q9ERV1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mkrn2Q9ERV1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mkrn2Q9ERV1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Mkrn2Q9ERV1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mkrn2Q9ERV1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mkrn2Q9ERV1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mkrn2Q9ERV1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mkrn2Q9ERV1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mkrn2Q9ERV1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mkrn2Q9ERV1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mkrn2Q9ERV1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mkrn2Q9ERV1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mkrn2Q9ERV1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mkrn2Q9ERV1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Mkrn2Q9ERV1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mkrn2Q9ERV1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mkrn2Q9ERV1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mkrn2Q9ERV1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Mkrn2Q9ERV1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mkrn2Q9ERV1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mkrn2Q9ERV1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mkrn2Q9ERV1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mkrn2Q9ERV1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mkrn2Q9ERV1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mkrn2Q9ERV1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Mkrn2Q9ERV1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mkrn2Q9ERV1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mkrn2Q9ERV1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Mkrn2Q9ERV1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mkrn2Q9ERV1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Mkrn2Q9ERV1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mkrn2Q9ERV1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mkrn2Q9ERV1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mkrn2Q9ERV1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms