Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERS2

Ndufa13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa13Q9ERS2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufa13Q9ERS2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufa13Q9ERS2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufa13Q9ERS2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufa13Q9ERS2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufa13Q9ERS2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufa13Q9ERS2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufa13Q9ERS2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufa13Q9ERS2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufa13Q9ERS2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufa13Q9ERS2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms