Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rp2Q9EPK2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rp2Q9EPK2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rp2Q9EPK2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rp2Q9EPK2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rp2Q9EPK2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rp2Q9EPK2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rp2Q9EPK2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rp2Q9EPK2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rp2Q9EPK2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rp2Q9EPK2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rp2Q9EPK2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rp2Q9EPK2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rp2Q9EPK2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rp2Q9EPK2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rp2Q9EPK2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rp2Q9EPK2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rp2Q9EPK2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rp2Q9EPK2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rp2Q9EPK2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rp2Q9EPK2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rp2Q9EPK2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rp2Q9EPK2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rp2Q9EPK2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rp2Q9EPK2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rp2Q9EPK2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rp2Q9EPK2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rp2Q9EPK2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rp2Q9EPK2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rp2Q9EPK2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms