Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP51

Vmn1r50, Vomeronasal type-1 receptor 50, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r50Q9EP51 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r50Q9EP51 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r50Q9EP51 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r50Q9EP51 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r50Q9EP51 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r50Q9EP51 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r50Q9EP51 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r50Q9EP51 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r50Q9EP51 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r50Q9EP51 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r50Q9EP51 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r50Q9EP51 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r50Q9EP51 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r50Q9EP51 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r50Q9EP51 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r50Q9EP51 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r50Q9EP51 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r50Q9EP51 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r50Q9EP51 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r50Q9EP51 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r50Q9EP51 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r50Q9EP51 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r50Q9EP51 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r50Q9EP51 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r50Q9EP51 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r50Q9EP51 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r50Q9EP51 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r50Q9EP51 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r50Q9EP51 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r50Q9EP51 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r50Q9EP51 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r50Q9EP51 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r50Q9EP51 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r50Q9EP51 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r50Q9EP51 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r50Q9EP51 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r50Q9EP51 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r50Q9EP51 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r50Q9EP51 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r50Q9EP51 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r50Q9EP51 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r50Q9EP51 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r50Q9EP51 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r50Q9EP51 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r50Q9EP51 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r50Q9EP51 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r50Q9EP51 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r50Q9EP51 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r50Q9EP51 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r50Q9EP51 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r50Q9EP51 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r50Q9EP51 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r50Q9EP51 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r50Q9EP51 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r50Q9EP51 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r50Q9EP51 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r50Q9EP51 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r50Q9EP51 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r50Q9EP51 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r50Q9EP51 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r50Q9EP51 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r50Q9EP51 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms