Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC61

Pmpca, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcaQ9DC61 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PmpcaQ9DC61 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PmpcaQ9DC61 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PmpcaQ9DC61 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PmpcaQ9DC61 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PmpcaQ9DC61 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PmpcaQ9DC61 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PmpcaQ9DC61 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PmpcaQ9DC61 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PmpcaQ9DC61 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PmpcaQ9DC61 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PmpcaQ9DC61 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PmpcaQ9DC61 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PmpcaQ9DC61 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PmpcaQ9DC61 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PmpcaQ9DC61 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PmpcaQ9DC61 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PmpcaQ9DC61 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PmpcaQ9DC61 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PmpcaQ9DC61 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PmpcaQ9DC61 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PmpcaQ9DC61 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PmpcaQ9DC61 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PmpcaQ9DC61 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PmpcaQ9DC61 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PmpcaQ9DC61 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PmpcaQ9DC61 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PmpcaQ9DC61 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PmpcaQ9DC61 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PmpcaQ9DC61 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PmpcaQ9DC61 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PmpcaQ9DC61 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PmpcaQ9DC61 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PmpcaQ9DC61 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PmpcaQ9DC61 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PmpcaQ9DC61 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PmpcaQ9DC61 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PmpcaQ9DC61 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PmpcaQ9DC61 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PmpcaQ9DC61 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PmpcaQ9DC61 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PmpcaQ9DC61 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PmpcaQ9DC61 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PmpcaQ9DC61 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PmpcaQ9DC61 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PmpcaQ9DC61 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PmpcaQ9DC61 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PmpcaQ9DC61 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PmpcaQ9DC61 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PmpcaQ9DC61 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PmpcaQ9DC61 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PmpcaQ9DC61 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PmpcaQ9DC61 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PmpcaQ9DC61 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PmpcaQ9DC61 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PmpcaQ9DC61 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PmpcaQ9DC61 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PmpcaQ9DC61 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PmpcaQ9DC61 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PmpcaQ9DC61 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PmpcaQ9DC61 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PmpcaQ9DC61 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PmpcaQ9DC61 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PmpcaQ9DC61 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PmpcaQ9DC61 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PmpcaQ9DC61 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms