Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim23Q9DAL0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim23Q9DAL0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim23Q9DAL0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim23Q9DAL0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim23Q9DAL0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim23Q9DAL0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim23Q9DAL0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim23Q9DAL0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim23Q9DAL0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim23Q9DAL0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim23Q9DAL0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smim23Q9DAL0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smim23Q9DAL0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smim23Q9DAL0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smim23Q9DAL0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smim23Q9DAL0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smim23Q9DAL0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smim23Q9DAL0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smim23Q9DAL0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smim23Q9DAL0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smim23Q9DAL0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smim23Q9DAL0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smim23Q9DAL0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smim23Q9DAL0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Smim23Q9DAL0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smim23Q9DAL0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smim23Q9DAL0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smim23Q9DAL0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Smim23Q9DAL0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smim23Q9DAL0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smim23Q9DAL0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smim23Q9DAL0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smim23Q9DAL0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smim23Q9DAL0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smim23Q9DAL0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smim23Q9DAL0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smim23Q9DAL0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smim23Q9DAL0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smim23Q9DAL0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smim23Q9DAL0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smim23Q9DAL0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smim23Q9DAL0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smim23Q9DAL0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smim23Q9DAL0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smim23Q9DAL0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smim23Q9DAL0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim23Q9DAL0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smim23Q9DAL0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smim23Q9DAL0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smim23Q9DAL0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smim23Q9DAL0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smim23Q9DAL0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smim23Q9DAL0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smim23Q9DAL0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smim23Q9DAL0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smim23Q9DAL0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim23Q9DAL0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim23Q9DAL0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim23Q9DAL0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smim23Q9DAL0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smim23Q9DAL0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smim23Q9DAL0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smim23Q9DAL0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smim23Q9DAL0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smim23Q9DAL0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smim23Q9DAL0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms